对于员工6月入职，想让公司补交4、5月份的社保，公司面临的主要风险有以下几点： 一是可能补缴的费用超过正常补缴的费用，因此公司有可能因此发生财务损失，从而影响公司的财务状况。 二是补缴社保费势必会增加财务负担，这会对公司的资金使用和经营状况产生一定的负面影响。 三是因补缴社保不按正常流程办理，可能会导致政策依据混乱、政策执行不统一，影响公司内部管理秩序，从而引发相关管理或法律问题。 四是有可能违反当地政府政策，因此公司可能会面临相关的行政处罚。 五是当公司补缴社保时，可能会出现各种税收问题，从而影响公司的合规状况，因此公司有可能面临税务检查等风险。 在关于补缴社保的问题上，尤其是补缴的时间段问题，企业需要根据法规来进行具体问题的解决，以确保公司信息和资源的安全和合规程度。因此，补缴社保时，公司需要按相关规定办理，防止可能带来的风险。