电子普通发票的通行费抵扣了，可以按照专票方式进行价税分离录入，主要是在发票核验时做出区分，避免出现不规则的现象。具体可以分为以下3步： （1）在发票管理系统中，登记属于通行费抵扣的流出（支出）信息； （2）在发票管理系统中，根据抵扣的通行费信息，申请发票开具和核验； （3）在发票管理系统中，根据开具的发票，按专票方式进行价税分离录入。 拓展知识：发票开具和核验中，针对专票需要提供一定的验证材料，比如购货方和销货方等资料，以确保发票的真实性。