一般来说，在上海总公司进行记账实际上并不能获得分公司在嘉兴代理记账的账目。这是因为，当上海总公司承担记账责任时，实际的记账任务将由上海总公司负责，而不是嘉兴的分公司代理记账。另外，尽管总公司的账目可以拿到分公司的代理记账，但通常情况下，企业的总公司以及分公司的账务记账是完全分离的，互不影响，因此，在上海总公司进行记账实际上也不会影响分公司在嘉兴代理记账的账务状况。 除了上述情况外，为了保证企业财务状况准确、安全，企业可以采取定期联系的方式，对总公司和分公司记账情况进行验证，以确保两方账务的准确性、安全性。此外，企业还可以通过建立ERP系统（Enterprise Resource Planning，企业资源规划）来统一管理公司的财务状况，更加方便地协调总公司和分公司记账情况之间的合理性。