小规模纳税人代开增值税专用发票，季报的时候需要缴纳附加费。附加费是指凡缴纳增值税的有责任纳税人，在依照《中华人民共和国地方税收征收管理法》及有关法律法规的规定，按照本市增值税征收管理的规定，应当在纳税期限届满时，缴纳的、由地方政府本级财政收取的税款。附加费主要用来补偿收入和投资经营成本，起到调节改善地方财政收入和经济发展的作用。 拓展知识：上海增值税附加费包括教育费附加、城市维护建设税、地方教育附加、地方环境保护税、地方基本医疗险等。其中，教育费附加和地方教育附加收入的使用范围只能用于改善教育条件、支持教育发展。而地方环境保护税和地方基本医疗险则可以支持环境保护和基本医疗险改善等。