作废发票第二联没收回将会带来一定的负面后果。 首先，如果收取的发票被发票抬头所使用，那么发票抬头将会面临罚款，因为没有发票第二联，表明发票可能出入过非法渠道，同时也会减少交易的可追踪性，从而导致他们可能会受到财务监管部门的监管。 其次，如果发票第二联被有关部门收回，发票抬头将无法将发票报销，从而导致他们的经营收入减少，财务损失也加大，出现财务困境的情况可能也就随之而来。 最后，如果发票第二联被有关部门收回，那么发票抬头在发票流转过程中可能并不合法，从而导致有关部门进行财务审核，甚至追究发票抬头的责任。 拓展知识：发票第二联也称发票核销联，是收票人或者购买原料的单位收货确认的发票，主要用于发票流转中的财务验证，是发票交易合法性和可信性的重要保障。