是的，部分允许扣除。根据国家税务总局有关规定，个人应缴纳的养老保险费和医疗保险费等社会保险费的缴纳人可以作为计算个人所得税的部分减免项目。根据有关规定，当个人自行缴纳社会保险费后，在工资表中，个人应交的社会保险费的减免额，即可作为个人所得税的减免项目，个人报税时可以一次性减免缴纳的社会保险费金额。 拓展知识：年终奖金中社会保险费被职工个人全额承担的，属于部分允许扣除类别之一，可按年终奖金中社会保险费额度作为个人所得税减免项。