企业租赁房屋支付的应纳税额40万，须交纳增值税。增值税税率一般是6%,根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第二十六条规定，企业出租不动产的，租金的税率为6%。企业租赁房屋交纳的增值税计算方法如下： 计算公式： 租金应纳税额=租金收入额×税率 租金应纳税额=40万×6%=2.4万 因此，40万元租金收入所产生的增值税，应当缴纳2.4万元。 拓展知识： 房屋租赁所产生的增值税是需要纳税人支付的，但是纳税人可以申请减免，根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第二十六条规定，企业租赁不动产的，租金的税率可以申请减至3%，但是需要有政府部门的特殊批准。因此，租赁企业可以根据实际情况向政府有关部门申请减税。