员工市内交通费的账目处理如下： 1. 员工在购买公交车票、地铁票、出租车票等市内交通票据时，应当出示有效的办公室发放的员工代表凭证，并在消费凭证上注明公司名称、消费用途、员工姓名等明确的内容。 2. 员工在出差活动中，如果出租车费超过200元，则需要出示费用发票，并在发票上注明公司名称、出差活动名称、员工姓名等明确的内容。 3. 对于未出示有效的凭证或发票的市内交通费，上级主管必须在结账时亲自签字作为认可。 4. 在审核市内交通费用时，应当核查员工是否出示有效发票，并分清哪些属于企业应负担的交通费，哪些属于员工自己的私人费用。 5. 拓展知识：记账凭证可能形式多样，有系统出纳转账支票、支付宝、微信等转账凭证，也可以有现金凭证、礼品券凭证以及支票等。对账目的处理不仅要求准确，还要求账目的完整性。