在从事运输代理服务的企业，收取的运输代理服务费，属于税收征管范围内的收入。一般情况下，运输代理服务费应由经营者根据企业所得税法及其实施细则确定、备案，向税务机关备案登记，并缴纳企业所得税。若企业未通过备案登记，将无法正常抵扣税收，且在即将报税时，仍有缴纳企业所得税的责任存在。 除了税收的考虑，运输代理服务费的收取，还要按照有关法规，如国家财政部、海关总署及各省税务局等部门出台的《企业经营活动收费标准的管理办法》等精心规划，以确保经营者在收费中不存在夸大虚假宣传、捆绑销售、价格重复加成、不公平竞争等行为。 拓展知识：企业从事运输代理服务可申请国家“三支一扶政策”，即原材料运费补贴、运输代理费补贴以及技术服务费补贴。此外，还可申请“两个落实”，即减免社会保险费和住房公积金；申请“一端补贴”，即劳动力安置补贴；申请“一个贴补”，即短期费用补贴。