做社保晚申报时需要扣除的滞纳金应做如下分录： ①借：应付职工薪酬（贷方） ②贷：应付社保费滞纳金（借方） 其中应付职工薪酬是社保滞纳金的基数，扣除滞纳金后，该金额需要在财务账上减少，因此对应贷方借方发生变化，由减少而增加。而应付社保费滞纳金是社保滞纳金的金额，应当反映在财务账上，因此对应借方贷方发生变化，由增加而减少。 拓展知识：滞纳金是企业误期交纳社保费用时由社保局向企业收取的罚款，其收取标准通常按月收取，按照国家规定，当滞纳金余额超过1个月时，就需要进行清算。此时，企业按照实际缴纳滞纳金金额，从职工工资中直接扣除，然后将扣除的滞纳金金额支付给社保局。