一般情况下，再一起发放月薪工资5000元时员工要进行个税申报，实际上是按照季度来计算个税。 首先，员工应当每个月在工资发放时就做好个人所得税的预缴，并把预缴的个税缴纳到税务系统中，保证相应的税款缴纳到政府指定的缴款账户中。 其次，员工在纳税申报时，应当当期的收入就拿当月的工资5000元来进行申报，将当月工资的实际收入减去应当缴纳的个税金额，算出个人工资收入超出税前扣除项目后的实际税前收入，根据个税起征点，可仢算出应缴纳的个税金额，把算出来应缴纳的个税金额和税务系统中记录的缴纳金额比较，如果发现差额，就应该及时补交差额个税，该差额应在税务系统及时缴纳；如果确认计算出的个税金额和实际缴纳的金额相等，则可以正常完成纳税申报，以示纳税合规。 拓展知识：从2018年1月1日开始，根据国家规定部分小微企业可以按月申报个税，并免征一定金额的个税。具体情况可以咨询当地主管税务机关了解更多信息。