实际上，股东股权转让低于实缴资金时，需要缴纳个人所得税。流程是，当股份转让结束后，卖方应当向税务机关申报实缴资金减去转让股份所得款，实现净计算所得额，扣缴个人所得税，交税后方可办理股权变更登记。另外，在完成个人所得税的缴纳后，双方还需要做好合同签订，将双方的权利义务明确确认，以确保收购完成。 拓展知识：股权转让所涉及到的个人所得税不仅仅与股权转让款有关，还包括股权转让内所获得的相关税收优惠，比如投资所得的免税等。此外，在发生股权转让的同时，还需要留意关联方的影响，确保买卖双方的法律利益及行为均合法有效。