在处理企业收到应付商户延迟清算款时，首先要核实收入同时也要核实应付款项是否及时结清。应先将收入部分合理登记在企业账户，而应付款项部分则需经审核确认，并准确记录在帐，以便后续核实。若有手续费要支付，可进行资金调拨，将企业账户中对应金额支付给商户。最后，可进行应付款项再核对，确保账目真实准确。 在此过程中，关键是要保证账目的准确性，以及确保按要求结算款项。而且，企业还要建立完善的审查机制，以确保清算过程中的资金安全。 拓展知识：商户延迟清算款又称延期收/付款，指商家通过延迟清算的手段，以一定的时间和利率安排收款或付款的金融交易类型。延期收/付款可以节约资金成本，改善经营效率，提升收支现金流状况。