根据《增值税暂行条例》，免税水果批发企业购进免税水果用于销售可以抵扣进项税额，其中，购进1000千克免税水果，收取发票不含税单价2元/斤，那么在此情况下，1000千克应当等同1000斤，进项税额=1000斤×2元/斤×3%=60元，由于途中被盗100千克，抵扣进项税额量=60-100*2*3%=48元，余下的水果运回后加工成果酱300千克，其中100千克用于发放集体福利，100千克被盗，100千克对外出售，只能抵扣已加工的果酱的进项税额。总的抵扣进项税额=48元+300*2*3%=84元。 综上所述，可以抵扣的进项税额为84元。 拓展知识： 对于加工果酱的免税水果，企业在加工过程中会产生损耗，该部分可以抵扣进项税额，但是要求企业必须开具《损耗发票》才能抵扣进项税额，凭借该证明即可申报抵扣进项税额。