如果公对公付款时开出的发票金额与实际付款金额发生偏差，在此情况下，首先要确认的是开票金额是否准确，以及是否有其他特殊事由，如结算失误，可能造成发票开出金额与实际付款金额存在偏差。如果是付款双方的失误造成的，可以要求双方签署书面协议，明确说明发生偏差的原因，并按照实际付款金额进行结算。同时要配合税务部门进行税务票据报表的修正工作，以确保会计核算准确。 拓展知识：在企业从事会计核算活动时，发票是通常要求的重要凭证。因此，对于发票的处理尤其重要，不仅需要开票及纳税人正确处理，在付款时亦需注意，以免产生税款错算的问题。