在公司注销的时候，50万存货必须要处理掉，可以按照以下步骤来处理： 第一步，对存货进行整理，将其分类整理，并列出所有的存货物品。 第二步，进行盘点，确定各类物品的数量，以及存货的总价值。 第三步，安排拍卖活动，将存货出售掉，将其转换为现金，以处理公司的债务。 第四步，将现金交付持有负债单位，偿还公司的债务。 拓展知识：存货在拍卖活动中，可以按正常市场价格或者折价出售，也可以通过竞价的方式获得更高的价格。此外，还可以通过租赁，出租存货，从而降低债权人的损失，这样可以获得更多的收入。