在申报期内申报增值税后作废申报，可以重新勾选抵扣的发票。以下是具体操作步骤： 1、在计算机上登录税务网站，进入增值税系统，选择发票勾选管理。 2、点击月度税款申报菜单，根据税务登记号码和发票号，勾选相应的发票。 3、勾选好发票之后，根据提示说明提交申报，申报完成后作废申报即可重新选择抵扣的发票。 拓展知识：在增值税的申报过程中，发票选择需要根据不同的税务合规要求进行正确的认定和抵扣，以保证政府税收收入的正常积累和税务管理政策的落实。