根据税收法规，当企业要注销时，其进项税应该作如下处理：首先，对于未发生销售的商品，应当按照原进项税额进行退税；其次，对于已发生销售的商品，应当将进项税税额与销项税税额进行抵消；最后，如果仍然剩余任何进项税税额，则应当按照原进项税额进行退税。 拓展知识：关于进项税的抵扣，可以在企业间协商约定，也可以申请国家处理，一般来说，通过国家处理会更加安全，以免伤害企业之间的关系。