根据相关法律法规，两千平方的防火涂料和两千平方的防腐喷漆工程应当收取增值税。 首先，在开发票的过程中，应当确定根据《中华人民共和国增值税暂行条例》，以及相关的工程税率标准，确定相关的税率，一般是在6%~13%之间的范围。 其次，确定税额后，应当办理税收登记，相关税务机关会在审核通过之后分配一个税号，用于开具发票。 最后，开具发票时，应当按照工程款和税额进行填写，确定成本中税费的支出金额，最终发票通过审核，结算完毕后，税额将会被正式收取。 拓展知识：税收法律法规的制定和修改均受到相关政策的影响，如有变动，住户在办理发票时应当注意查询最新的税率标准，以免错失相关抵扣政策。