对于通过农民工专户发放的农民工工资，应当在申报前进行登记备案，根据税收政策和准则，逐一登记所有发放的农民工工资，并将登记所得的纳税凭证报送税务机关备案。账务处理时，将农民工工资的发放作为入帐项目，并凭农民工专户的收支明细分类报送。同时，入帐时也需要同时录入个人所得税付款金额，以确保整个付款过程完整可查，保证税务备案准确无误。 拓展知识：现在，一些税务机关也采用网络技术，让企业或个人在网上完成税务申报，这样可以大大提高效率，减轻企业负担，有利于减少纳税负担和促进经济健康发展。