对于征地款的处理，首先要根据实际情况来确定账务处理方式。若甲方委托我司代征地，相关征地款根据甲方的要求，可以直接转到我司的对公账户上，由我司作为征地款的付款方，用来支付征地款。这笔资金的账务处理，可以采用“应付款”的账务方式，应收的科目为“应付款”，应付的科目为“支付的征地款”。若要对这笔资金进行单独核算，可以建立一套专用的账套，将收到的征地款登入该账套，以便于进行独立核算和管理。