不能在网上操作完成跨市跨区的外地工程办理完税证明。因为，有关完税证明的操作，受到严格的财政要求，必须申报原件到有关税务局办理，才能取得完税证明。所以，在跨市跨区的工程办理完税证明，只能按照有关规定咨询税务机关，并到有关财政部门原件缴纳税款，由有关财政部门出具完税证明。 此外，跨市跨区外地完税证明的办理，还需要做更多其他准备，如到有关财政部门提供完税证明申报表，以及填写海关报件单等，才能顺利办理完税证明。 拓展知识：完税证明也可以采取其他办法，如增值税专用发票、手续费发票等凭证，都可以用于所得税完税证明。