根据国家有关规定，分公司只能按照中央国家机关有关规定签订合同，发票由分公司开具，回款也应该由分公司收取，所以合同和回款用分公司。如果分公司真的用总公司投标，一般要求总公司把项目执行权和合同款项单独转移到分公司，以便分公司能独立完成项目执行，也为后续发票和回款准备等等手续，这样才能被税务部门认定为小规模纳税人。 此外，还要注意的是企业要做好记账凭证的准确性，尤其是分公司和总公司账簿之间的调拨，以及合同负责人、付款负责人和收款负责人等要做好当前账目与分公司账簿之间的关联，以便分公司能对全部发票、回款做到无漏单的管理。