企业年度所得税汇算清缴补缴时，首先要确定其纳税义务人属于哪种纳税人，例如是一般纳税人还是小规模纳税人，这对应于不同的财政收支账户记账方式，以及纳税申报按照要求上报的科目要求；其次，确定企业今年应纳税款分别是属于哪几种税种、哪个期间，及企业是否有缴纳滞纳金等；再次，根据当期纳税款及滞纳金的数额决定是一次性缴纳还是分期缴纳，是在税务机关窗口汇算清缴，还是申请先行汇算后再补缴；最后，根据所选择的纳税方式，填写税务机关规定的申报表，在税务机关窗口提交，最终完成企业的年度所得税汇算清缴补缴。 拓展知识：企业在汇算清缴中，应当按照汇算清缴规定申报自行计算纳税款，并在汇算清缴期限前，将缴款凭证及汇算清缴申报表一并提交税务机关，由税务机关审核后再进行财政结算，其中申报的税种包括：所得税、增值税、消费税、资源税、地方教育附加等相关税种。