公司应该先联系对方，询问原因，并要求对方补足缺少的3元，或者提供由公司验收的证明等，以免发生纠纷。 在账务上，首先在银行存款日记账中，将运费款分别记入借方“应付账款”核销，贷方“现金”核销；其次，再记录此项费用差额，将发票金额为（实付-实际发票）记入借方“应付账款”，贷方“其他应付款”；最后，核实运费发票差额，记录缺少的3元发票金额，其借贷方向与上面记账相同，但金额由3元变成0元，即“应付账款”减3元，“其他应付款”加3元，以归集账务数据。 拓展知识：账务是企业中重要的一个部门，是企业资金来源和流向的一面镜子。账务是企业资金经营过程中必不可少的管理工作，必须通过合理的账务处理和严格的核算程序，保证公司资金安全和流程正确，从而保证企业的正常经营。