依据《增值税暂行条例》（下称“条例”）第十六条“发生进项税额抵扣的增值税预缴的，抵扣方当期内应纳税额不足时，可向税务机关申请预缴税款；抵扣方当期内应纳税额超过抵扣的进项税额时，可抵扣相应的应缴税款。”结合该句意思，当承包方和分包方均为异地时，由分包方向税务机关申请预缴税款。 首先，分包方应开具预缴税款专用缴款书，填写完整并附带有关凭证资料向税务机关申请预缴税款。经税务机关审核后，根据所提交的资料确定预缴金额，并出具凭证收据。 此外，如果分包方发生的进项税款的查验程序被推迟，也可以向税务机关申请预缴税款。税务机关收到申请后，若审核无不当之处，则给予准予预缴的凭证收据。 总的来说，当承包方和分包方均为异地时，由分包方向税务机关申请预缴税款，待受理后，将由税务机关出具凭证收据方可正式预缴税款。 拓展知识：预缴税款纳税义务人应按月分次缴纳，预缴税款不能多缴也不能少缴，以税务机关凭证收据为准，一般通过手机APP或者官网完成预缴税款的缴纳工作。