是的，在申报附加税的时候，留抵退税退的增值税可以在计税依据几中扣除。这是因为，根据《中华人民共和国企业所得税法》和《中华人民共和国企业所得税暂行条例》的规定，企业留存的增值税可以按照销售额的比例扣除。具体来说，企业在上一个月内产生的增值税，其中经过抵扣退税的，可以在下一个月申报附加税的时候在计税依据几中扣除，以减免纳税义务。 拓展知识：企业留存的增值税可以按照月度税率减免销售额，减免以后的销售额即为减除后的税率，由此可以得出纳税基数，然后再按照企业所得税的税率进行纳税。