根据《中华人民共和国税收征收管理法》，施工合同中的印花税是可以收取的。具体收取方式取决于双方约定，常规情况下，签订合同的一方应用印花税计税备案，并按照税务管理机关规定，按时向税务管理机关申报办理印花税确认和缴税手续。 开票要按照实际服务或者交付物品为准。如果对方来施工，而且包括设备，可以开具施工及设备费综合发票，品名填“施工及设备单价木结构”。如果把施工和设备分开填写，可以分开开具“施工费木结构”和“设备费木结构”发票。并且发票上一定要注明收款人是建筑公司。 拓展知识：施工合同的印花税是在各省税务局规定的范围内收取的，一般可以在本省税务局查询，也可以查询《中华人民共和国税收征收管理法》来查看详细规定；另外，开票时需要根据实际服务或者交付物品来决定开具什么品名及收款单位。