股东往来款转入资本公积会涉及所得税，一般情况下，股东从资本公积中提取款项，因其属于股东自由提取款项，其中蒙受的所得属于股东当时收到的股东分红所得，需缴所得税；有些企业允许股东把款项转入资本公积，此时，股东转入资本公积的款项，其中不仅涉及股东的财产权益，也涉及企业的财产权益，及时股东未蒙受直接的经济利益，但从现金流的角度，股东当前把股东往来款转入资本公积，也属于投资支出，其股东往来款转入资本公积，其中也同样涉及所得税。拓展知识：资本公积是企业一种有重要意义的财务决策及征税手段，它可以有效的缩小企业所得税的负担，企业增资减股时，不仅需要将计入财务报表，而企业在有资本公积的情况下，可以将增资的款项缴入资本公积，缩小企业的所得税负担，同时又能维持企业的经营规模及经营活动的稳定性。