首先，你需要准备一份与发票抬头公司相关的协议，比如公司付款给发票抬头公司并由其代付本公司报销的费用，或者发票抬头公司向本公司报销开支再由本公司付款给发票抬头公司，以确保发票抬头公司和本公司都履行了合同义务，从而获得相应的税收优惠；其次，根据发票的抬头公司的收、付款，记账的方法有两种：一是本公司直接为发票抬头公司做账，二是本公司扣取税额后，将剩余款项支付给发票抬头公司。如果是第一种记账方法，则本公司应当先付款给发票抬头公司，发票抬头公司再向本公司报销，本公司付给发票抬头公司的款项经过做账处理后，反映在本公司的账户上；如果是第二种记账方法，本公司需要先把款项扣除税收后，再支付给发票抬头公司，同时本公司也要记账和报税，把税收内容和金额记录在应交税收中。拓展知识：此外，发票抬头公司开具的发票既可以是增值税专用发票，也可以是普通发票，具体情况要根据国家税收法律来抉择。