根据《中华人民共和国增值税改革实施条例》的规定，小规模纳税人农产品专用发票中开具的增值税可以抵扣9%。但是，小规模纳税人农产品专用发票中开具的增值税只能抵扣增值税，不能抵扣附加税和其他费用，如企业所得税等。因此，请确认专用发票中开具的税款种类是增值税，否则无法抵扣9%。 关于抵扣，增值税法规定，在纳税人销售产品或者提供劳务时，可以抵扣购买商品、接受劳务时产生的增值税，但是抵扣的金额不得超过当月应纳税额。另外，纳税人如果使用专用发票来抵扣购买商品、接受劳务时产生的增值税，只有在税款已经缴纳，且专用发票中开具的税款种类为增值税的情况下，方可抵扣。