根据会计原则，对于已经开票，但未发出发票或收到发票的预付账款，可以在财务系统中分录一条4月份的预付账款贷方的专票发票条目，并记入50万的费用和款项。收到的50万柴油专票，可以用作最终结算的财务凭证，在收到甲方对应的发票作为财务结算凭证后，进行结算，并做一个付转单回单，将交易记录到案。此外，在预付款的处理过程中，有可能会出现收款方和开票方不一致的情况，因此，在财务结算的时候，还需要提出担保政策，并做好相关的担保凭据。