公司付房租没有发票入账的正确操作流程是：1.在公司明细账簿上记录支出情况，除了记录房租金额之外，还要记录相应的支出科目；2.在公司总账凭证中记录，应当按照日记账的处理流程，以科目代码记账，这样可以做到记录的准确性和完整性；3.将本次支出汇总到现金支出总计，以便做财务报表分析；4.月末结账时，将本次支出的房租金额汇总记录到公司的房租费用科目中；5.每次付款时，制作一张付款凭证，将付款金额、付款时间、付款科目、付款方式等明细填写好，作为公司付款凭据，以便有关财务稽查。 拓展知识：付款凭据是企业经营会计活动中经常使用的支付书证，它是一种可以支持对支出进行证明、证实和查账的凭据。付款凭证主要包括付款科目、付款金额、付款日期、付款方式、收款人姓名、收款人账号等。付款凭据是企业经营会计活动中必不可少的管理工具，凭证的记录和使用是企业经营会计活动不可或缺的一部分。