一、甲公司购买专利权对乙公司转让的会计处理： 1）甲乙双方登记账簿： 甲公司： ① 应收票据：100000元 ② 专利费用：600000元 乙公司： ① 应付票据：100000元 2）银行登记账簿： 应收账款：100000元 二、收入税会计处理： 1）登记账簿： 增值税：6000元（100000*0.06） 2）收入税的核算及结算： 税收科目：增值税 税金数额：6000元 甲公司应收：94000元 乙公司应付：94000元 拓展知识：按国家有关规定，转让非存货及非不动产专利权，只要双方属于增值税一般纳税人，均应按照6%的税率收取增值税。如果两个公司均属于小规模纳税人，则收取3％的增值税。