是的，可以进行这样的操作。当客户账户支付租金时，可以通过发票开他们分公司的方式登记相关交易。首先，应收租金的金额应登记在客户的租金应收账款凭证内，根据客户要求开具分公司的票据；其次，登记分公司的票据应根据客户实际付款金额开具发票，并根据财务部门要求准确登记到固定资产折旧和租赁费收入等相关科目；最后，当客户支付给租赁公司时，根据客户付款来源，应按照合同约定将客户支付的租金计入租赁公司收入账户登记。 从财务操作上，准确记录和开具发票有助于公司准确统计账目，对于及时收取客户应付款，准确按合同约定交付租赁物的实现也是非常有帮助的。同时，在收款支付时还需要根据实际情况开具发票，以加强财务管理。