招标保证金的设置科目一般是在招标程序中规定的，主要分为投标保证金和违约保证金两种，其中投标保证金的科目一般是由中标者支付，以担保中标者在约定期限内履行投标书中的承诺；违约保证金的科目一般是由承标者支付，以担保承标者在约定期限内履行合同义务。 招标保证金科目的设置，还应当考虑双方的实际情况，如双方实力强弱，招标项目的性质与规模等等；同时，这份招标保证金科目也可以根据商谈协议进行有效的补充与修改，也可以依据双方的一致同意事项而取消，以保证本次招标的公平公正。 拓展知识：另外，在招标过程中，应当充分考虑招标保证金的退还问题，一般应在合同签订后的三十日内或符合当地法律法规的其他时间内，由招标主体负责将保证金退还至中标者账户，确保参与投标者的利益不受损失。