单位扣个人所得税，应该按照个人的收入情况，按适用的税率，从个人收入中扣除应纳税额。个人所得税的应纳税额是根据个人收入的实际情况来确定的，当所得税的实际缴纳金额比应纳税额低时，就应该扣取应纳税额；如果所得税的实际缴纳金额高于应纳税额，则应当扣取应补退税额。 拓展知识：通过实施个人所得税制度，国家可以稳定收入分配，确保公平性，同时调整一定量的财政收入，为国家发展支出、经济增长提供资金保障。其中，应纳税额是按照法定的税率从个人收入中扣除的税款，应补退税额是按照法定的税率从个人收入中补退或退还的税款。