农业企业支付的青苗赔偿费的分录应该如下： 1. 借：应付款项 —— 青苗赔偿费账户； 2. 贷：银行存款账户 —— 付款金额； 就是说，农业企业支付的青苗赔偿费，是从银行存款账户扣除相应现金，转入应付款项—青苗赔偿费账户中。 拓展知识： 青苗赔偿费，是指农业企业为补偿青苗受损而支付的费用，这是一种社会保险性的费用，但由于青苗的损失是由企业的自然灾害引起的，因此，这笔费用可以记入企业的银行存款账户，记账时只要将银行存款账户中的相应现金转入应付款项—青苗赔偿费账户中即可。