在个人独资企业转让不动产时，应按照“财产转让税”征收税款。根据《企业所得税法》的规定， 《不动产》中的一些财产的转让，如土地、水面使用权等，应按照规定的实际所得额按照九种所得的税率分别支付税款，以上的税款的计税方式分别是： 一、企业所得税：根据实际所得额乘以企业所得税税率（25%）计算得出。 二、个人所得税：根据实际所得额乘以个人所得税税率（20%）计算得出。 三、增值税：根据实际所得额乘以增值税税率（20%，5%，3%）计算得出。 四、房产税：根据实际所得额乘以房产税税率（1.2%）计算得出。 五、土地增值税：根据实际所得额乘以土地增值税税率（20%）计算得出。 六、营业税：根据实际所得额乘以营业税税率（3%）计算得出。 七、土地使用税：根据实际所得额乘以土地使用税税率（2%）计算得出。 八、教育费附加：根据实际所得额乘以教育费附加税税率（3%）计算得出。 九、城市维护建设税：根据实际所得额乘以城市维护建设税税率（6%）计算得出。 拓展知识：个人所得税是指一般纳税人在各种收入所取得的收入估算、计税范围内，根据财政部的有关税收法规制定的税率，按照政府设定的税种，在个人收入合计总额上缴纳的税款。