补缴三代手续费返还增值税应该分为以下几步进行分录： 首先，应该做"记账收入"，贷方科目存放在银行存款，借方科目为其他应收款。 其次，应该做"付款凭证"，贷方科目存放在应交税费，借方科目为银行存款。 最后，应该做“收款凭证”，贷方科目存放在其他应收款，借方科目为银行存款。 补缴增值税的过程是企业将之前未交的税费补缴，以便合规符合法律法规。应该特别重视，认真编制分录，以免因分录出错造成不满足法律要求的后果。 此外，企业在补缴税费的过程中，要注意申报税费的税种，税率，税额等。应根据企业实际情况，准确的申报税费，以避免出现漏税的情况。