物流公司代收货款的手续费发票的税率取决于货物的名称，根据“中华人民共和国增值税政策性文件”，如果是普通商品，发票上的税率应为17%；如果是教育服务、文化服务、科技服务、社会职能类服务，发票上的税率应为11%；如果是其它服务和劳务，发票上的税率应为6%。 此外，发票上除了增值税外，还包括个人所得税，普通商品的消费者发票不需要缴纳个人所得税，只需要缴纳增值税；而服务消费者的发票，则不仅需要缴纳增值税，还必须缴纳个人所得税。 拓展知识：物流公司代收货款的手续费中，可以不缴纳增值税，但是仍需要按照《增值税普通发票》规定做好相关记录。