按照相关法律法规，企业采取税前扣款的方式进行社会保险及医疗保险的缴纳，此种情况下，将在计算员工的应发薪酬时，直接从薪酬中扣除该企业应缴纳的社保与医保费用，然后传达至当地社保及医保机构，最终支付给机构，因此自然人扣缴端进入工资薪金申报时，需要按应发计工资在税前扣除社保和医保的金额。从本质上来说，税前扣款和税后扣款的区别就是，税前扣款是在应发薪酬中作减法，税后扣款是在实发薪酬中作减法。 相比之下，当企业采取税后扣款的方式进行社会保险和医疗保险的缴纳，即由企业计算员工的实发薪酬，再从计算出的实发薪酬中扣除企业应交社保和医疗保险费用，最终支付给机构，此时有利于税收负担减轻，对于某些薪酬总额很低，一旦采取税前扣款，就会导致员工实际获得薪酬非常低，税后扣款可以减轻员工的税收负担，提高员工实际收入水平。