独资小规模纳税人开机械租赁发票的税率一般是3%，不同的地区有不同的具体要求，建议企业在办理税务时咨询当地税务局，以获得最新的税率政策。此外，租赁发票有两种，一种是融资租赁发票，一种是自用租赁发票。融资租赁发票是企业通过融资租赁公司以租赁的形式购买设备的费用，可以免除增值税的税负；自用租赁发票发票用于企业向第三方租赁机械设备使用，由第三方支付租金支付给企业，此种发票不能免增值税，而发票税率需按正常增值税税率征收。最后，需要说明的是，如果机械设备被自用、出租或者出售，税率将按照正常销售费用征收，也就是17%的增值税税率。