这样操作会对库存和成本产生一定影响，而且还可能会引起税务机关的关注。因为在进项发票上的货物没有全部销售出去的情况下，如果将该进项发票认证抵扣，则说明企业准备把购进的货物发出去，此时商品的成本就会有所增加，从而导致企业的期末成本也会增加，对库存有一定影响。另外，由于进项发票上的货物没有全部销售出去，如果企业将其于发票认证抵扣，这可能会被税务机关认定为非法抵扣行为，从而对企业产生不利影响。 总之，企业在进项发票上的货物没有全部销售出去的情况下，将其认证抵扣不是一个明智的选择，企业应当选择其他更合理的方式抵扣税款。 拓展知识：发票抵扣税款的方法不仅仅是认证抵扣，企业还可以选择累计抵扣，分期抵扣和普通抵扣等方式抵扣税款。累计抵扣是指期末税额计算完毕后，对应的累计应税项目，以一次性抵扣的方式抵扣税款；分期抵扣是指税额每月结算时都会抵扣上月累计应税项目；而普通抵扣是指每月抵扣本月累计应税项目。