企查查系统上留有企业的电话可以通过登录商务部平台进行更改。更改工商系统留有的手机号，首先需要企业法人到指定的地点进行现场核查证明，才能进行更改手机号操作，现场核查包括：企业主体核查证明，被授权代表现场核查证明，联系地址核查证明。核查完成后，企业法人需要重新操作注册，登录商务部平台，进行“申请变更登记”操作，然后选择“信息变更”操作，在变更信息项中选择变更手机号，然后填写新的手机号，点击提交，完成更改手机号操作。 拓展知识：企业变更登记申请操作若涉及企业法定代表人变更，企业名称变更或企业组织机构代码证变更的，还需要在报送资料中额外添加对应的变更证明文件凭证。