您好，对于直接处罚施工方10000元，款项从进度款中扣除的，开票时发票应该是开未扣除罚款的金额，罚款做账，可以使用凭证类型：罚款转入应收账款的方法做账，凭证略为调整：应收账款科目借10000元 ；贷：罚款收入科目10000元，则罚款款项入账及结算工作完成。 拓展知识：罚款转入应收账款的做账方式，是将罚款费用作为客户的欠款进行登记，将它归入账本，从而达到把罚款款项纳入资金循环的目的。