当法人股东变更时，其缴纳税款方式取决于变更后的股东的实际情况。如果变更后的股东是国有股东，则不需要缴纳税款。然而，如果变更后的股东是私人股东，则根据财政部的《中华人民共和国企业所得税法实施细则》的规定，变更后的私人股东需要缴纳变更所得税。变更所得税的计算比例为转让价格减去变更前股权面值后所产生的利得，再乘以当地政府规定的税率，以计算出变更所得税的金额。此外，如果变更后的股东是外国人或者外资机构，则需要缴纳营业税、增值税和其他税款。 拓展知识：企业变更法人股东时，除了需要缴纳一些税款外，还需要按照国家规定完成一系列法律手续。这些手续包括： 1、经营者变更登记：需要在工商登记部门提出变更登记申请，并提交相关证明文件，进行经营者变更登记； 2、相关资质取得：由于股东变更，企业可能需要重新申请一些相关资质，例如税务登记证、社会保险登记证等； 3、财务核算变更：股东变更完成后，变更影响企业的财务核算，包括资产负债表、损益表、现金流量表等，需要对原有的财务数据进行调整； 4、公司章程修改：企业法人股东变更后，需要对公司章程进行修改，以确保章程内容与企业实际情况一致。