处理增值税电子普通红字发票的具体流程如下： 1、发票核销：收到发票后，首先要进行核销，将发票的基本信息与合同的基本内容进行核对； 2、发票冲销：当发票的金额大于当期应付款时，可以进行冲销，即发票的金额大于应付款，就可以用发票的剩余金额来冲抵下一期的付款； 3、税务申报：发票核销和冲销完后，要将发票的信息提交给主管税务机关进行申报，税务机关根据发票信息对其进行审核，审核完成后才能认定其为抵扣税额； 4、发票登记：将发票信息与税务机关的审核结果登记到本企业的账务记录上，以便今后开展相关的税务审计。 以上是增值税电子普通红字发票的处理过程，但并不是所有发票都可以归类到此处。在实际操作中，要根据不同发票的不同特性再做出相应的调整，以更好地满足企业的实际需求。