要在公司两个厂和老板个人的账目中进行分开做账，首先，我们要明确各厂和老板个人之间的收支情况。其次，两个厂之间的往来账目要进行实时结算，确保公司利润的准确性。最后，要按照规定的标准制定财务报表，以确保财务状况的正确报告。 拓展知识：此外，为了有效的实施分开做账，我们还需要建立完善的财务管理制度，如统一财务经营流程，设置严格的管理机制，建立完善的内部控制体系，控制资金流向，确保两个厂及老板个人的财务状况都能得到准确的记录。