当税务局通知自查时，有关方面应该按照税务机关的文件进行办理。首先，应当尽快按照税务机关的通知按照要求进行检查，如果不明白文件中的要求，应当及时向税务机关咨询。其次，要根据税务机关的检查要求，对公司的管理状况、财务状况、会计核算等方面进行检查，逐项完成文件上的要求。接着，要及时向税务机关提交完整的材料，提供必要的说明文件，说明检查事项。最后，按照税务机关的要求做好检查文件的存档，以备查阅。 在自查过程中，企业可以采取多种措施来利用财务软件和会计模型，管理和控制企业的财务状态，以便税务机关能够获得全面、及时、准确的信息，以作出正确的税务决策。另外，企业还应定期审计财务报表，检查企业财务状况并及时反应到税务机关，以便税务机关能及时、正确做出决策。